新冠病毒刺突蛋白B细胞线性表位发掘

摘要

目的:发掘2019新冠病毒刺突蛋白中适合抗体识别的B细胞线性表位。方法:据GenBank记录的新冠病毒刺突蛋白S区氨基酸序列,在线工具预测候选线性表位,用SwissModel同源建模定性筛选位于表面的候选线性表位,再用Emini、Karplus-Schulz法定量比较候选线性表位空间可及性以及柔韧性,用BLASTp搜索NCBI数据库判断候选线性表位特异性,最后再据在线预测和文献报道糖基化位点排除有较大空间位阻的位点。结果:发现以QLPP和RARS为代表适合抗体识别的线性表位。结论:对新发突发病毒传染病,发掘病毒关键蛋白抗原表面适合抗体识别的线性表位,为应急研发抗体阻断病毒感染及免疫检测病毒特异抗原提供参考。